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液体活检作为一种非侵入性肿瘤检测手段受到了越来越多的关注,主要检测肿瘤或转移灶在血液中释放的游离DNA(Cell-free DNA,cfDNA),对肿瘤特定基因型进行分析。这种血液基因检测可以为癌症治疗的临床决策提供依据。对晚期非小细胞癌患者(NSCLC)来说,快速准确的EGFR、ALK和ROS1基因突变检测对治疗方案的选择或更换至关重要,液体活检可以避免常规组织学分析中存在的检测时间慢、被检组织量少等问题。但从血液中检测基因突变的可靠性和实用性到底如何,仍需要大量的临床实践来检验。
近日,来自美国哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所的Adrian G. Sacher团队开展了一项前瞻性验证研究,旨在分析血浆微滴式PCR(Droplet Digital PCR , ddPCR)用于快速检测EGFR和KRAS基因突变,以及EGFR T790M耐药突变的可行性。研究结果2016年4月7日在线发表于JAMA Oncology杂志。
主要研究内容
研究时间自2014年7月3日至2015年6月30日。
入组患者需要满足以下要求:
◇年龄≥18岁
◇病理活检证实为进展期或复发性非鳞状NSCLC
◇新确诊的患者(cohort 1)
◇EGFR TKI耐药的患者(cohort 2)
◇准备接受新的全身治疗
◇有肿瘤组织样本或准备重复穿刺活检
◇放射影像学可证实病灶存在
对入组研究的患者采取血液样本,分离血浆。使用ddPCR分析平台检测血浆中的循环肿瘤DNA,在cohort 1组中检测EGFR基因exon 19del、L858R和KRAS基因G12X;在cohort 2组中检测EGFR基因exon 19del、L858R、T790M。
主要研究结果
入组的180例进展期NSCLC患者中,女性112例(62%),男性68例(38%)。中位年龄62岁(37-93)。新确诊患者(cohort 1)120例,获得性EGFR耐药(cohort 2)60例。
肿瘤基因型包括:80例EGFR基因exon 19/L858R突变,35例EGFR基因耐药突变T790M,25例KRAS G12X突变。血浆ddPCR中位检测时间(TAT)为3天,而肿瘤组织基因检测中位时间在cohort 1组为12天,在cohort 2组为27天。
从上图可以看出,血浆ddPCR检测阳性预测值(PPV)在EGFR基因exon 19 del、L858R和KRAS基因均为100%,而在EGFR基因T790M为79%。敏感性在EGFR基因exon 19 del为82%,L858R为74%,T790M为77%,而KRAS基因为64%。
多处转移和肝转移、骨转移的患者中,血浆ddPCR检测EGFR和KRAS基因突变的敏感性更高。
结语
从上述研究可以发现,微滴式数字PCR从血浆中检测肿瘤特定基因类型将来或可在进展期NSCLC中发挥重要作用。这一新型检测技术能够快速检测EGFR和KRAS基因突变,假阳性率低、稳定性良好。对于不愿接受重复活检的靶向耐药肺癌患者,ddPCR检查提供了另外一种选择。但ddPCR不能完全代替病理活检,两者的检查结果在临床中可以相互补充。
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文献来源:Adrian G. Sacher. Prospective Validation of Rapid Plasma Genotyping for the Detection of EGFR and KRAS Mutations in Advanced Lung Cancer. JAMA Oncol. Apr 7 ,2016. [PMID: 27055085]